《物種起源》的出版，生物進(jìn)化理論的提出，受到了無產(chǎn)階級革命導(dǎo)師馬克思和恩格斯的高度贊揚(yáng)，也得到了進(jìn)步學(xué)者，如胡克、赫胥黎、華生、格雷和華萊士等人的熱情支持。然而，那些堅持“神創(chuàng)論”觀點(diǎn)的自然科學(xué)家們卻對生物學(xué)領(lǐng)域里的這場大革命抱著極端敵視的態(tài)度，他們利用《科學(xué)協(xié)會會報》等刊物，連篇累牘地發(fā)表文章，攻擊達(dá)爾文和他的學(xué)說，其中包括他劍橋時代的老師、對他有過巨大幫助的著名地質(zhì)學(xué)家塞奇威克。與此同時，極力維護(hù)神學(xué)的主教和教士們則利用神學(xué)院聲討達(dá)爾文的著作，斥責(zé)達(dá)爾文的進(jìn)化論是“褻瀆神明的異端邪說”，《物種起源》“是一種推翻上帝的陰謀，意在擾亂對神的信仰，企圖毀滅上帝�！彼麄児�開叫嚷，要“圍剿達(dá)爾文，打倒達(dá)爾文！”妄圖把科學(xué)史上這場革命扼殺在搖籃之中，反動氣焰十分囂張。

一場進(jìn)化論同神創(chuàng)論、科學(xué)同迷信、真理同謬誤的戰(zhàn)斗不可避免了。1860年夏天，英國科學(xué)促進(jìn)協(xié)會在牛津大學(xué)召開會議。至此，反對《物種起源》同捍衛(wèi)達(dá)爾文學(xué)說的斗爭從書面論戰(zhàn)發(fā)展成了面對面的斗爭。達(dá)爾文因病不能與會，委托赫胥黎和胡克代表他出席。辯論開始后，牛津大主教威爾伯福斯搶先跳上講臺，妄圖用花言巧語蠱惑人心，煽動宗教情緒，控制輿論。他大肆宣揚(yáng)《物種起源》冒犯了造物主，不合神意，是對基督教的直接挑戰(zhàn)。他唾沫橫飛地講了半個小時，除了裝腔作勢，以勢壓人，別無一點(diǎn)科學(xué)內(nèi)容。大主教的胡言亂語引起臺下一批教士、教徒的喝彩、鼓掌和狂叫聲。隨后，赫胥黎從容地走上講臺，發(fā)表了長篇演說。他首先用平靜、堅定而又通俗易懂的語言，概括地闡述了達(dá)爾文進(jìn)化論的內(nèi)容，指出這個學(xué)說不是憑空捏造出來的，而是建立在20多年觀察研究基礎(chǔ)上的，反映了生物世界的客觀規(guī)律。它是科學(xué)真理和人類智慧的結(jié)晶。赫胥黎以雄辯的事實(shí)，富有邏輯性的論證，同大主教那種內(nèi)容空洞、語無倫次的謾罵，形成了鮮明的對比。他的語音剛落，進(jìn)步的聽眾，特別是青年學(xué)生立刻報以熱烈的掌聲。接著，胡克在聽眾的邀請下又作了簡短的發(fā)言。他用事實(shí)著重指出大主教威爾伯福斯并沒有看懂《物種起源》，甚至缺少有關(guān)植物學(xué)的最起碼的知識。原先氣勢洶洶的大主教聽了胡克發(fā)言后，再也沒有登臺答辯的勇氣，只好悄悄地溜出了會場。聽眾再一次向進(jìn)步學(xué)者，向真理的捏衛(wèi)者們報以熱烈的掌聲。會議在進(jìn)化論大獲全勝的氣氛中結(jié)束了。在這以后的20年里，盡管達(dá)爾文的學(xué)說影響越來越大，但是神創(chuàng)論者卻始終沒有停止過對達(dá)爾文的攻擊。

1860年，達(dá)爾文開始撰寫另一部規(guī)模更大的著作《動物和植物在家養(yǎng)下的變異》。由于他長期過度地工作，積勞成疾，以致身體狀況日益惡化，經(jīng)常被迫中斷寫作，致使這本巨著直至8年后才完成。隨后，他又不顧病魔纏身，經(jīng)過堅持不懈的努力，于1870年8月完成了《人類起源和性的選擇》一書的寫作，闡明了人類在動物界中的位置，人類同高等動物的關(guān)系，得出了人類起源于古猿的結(jié)論，奠定了唯物主義的人類起源理論的基礎(chǔ)。

由于達(dá)爾文及其生物進(jìn)化論對科學(xué)、對人類的杰出貢獻(xiàn)，美國、法國、德國、荷蘭、比利時、意大利、丹麥、瑞典、瑞士、俄羅斯等國家和地區(qū)的60多個科學(xué)研究機(jī)構(gòu)和學(xué)術(shù)團(tuán)體，先后授予他各種博士學(xué)位、會員、終身會員、院士等榮譽(yù)稱號和獎?wù)�、獎金。在各種榮譽(yù)面前，達(dá)爾文嚴(yán)格遵循的一個準(zhǔn)則是：名望、榮譽(yù)、享樂、財富同友誼相比，只不過是塵土罷了；自己應(yīng)該給人類帶來更多的光明，應(yīng)當(dāng)責(zé)無旁貸地把一生獻(xiàn)給科學(xué)研究。

1882年4月19日凌晨4點(diǎn)，達(dá)爾文這位杰出科學(xué)家的心臟停止了跳動，享年73歲，巨星隕落，舉世悲慟。人們?yōu)榱吮磉_(dá)對他的無比崇敬和永久紀(jì)念，將他安葬在倫敦威斯敏斯特國家公墓，和偉大的物理學(xué)家牛頓的墓并排在一起。

達(dá)爾文作為劃時代的偉大科學(xué)家，將永駐人間。